45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03701 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  84.44 
 
 		 481 aa  843    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  990    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  41.05 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  36.55 
 
 		 487 aa  310  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  24.74 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  26.15 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  33.14 
 
 		 292 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  24.1 
 
 		 200 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  26.1 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  25.25 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  26.26 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  23.32 
 
 		 200 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  23.32 
 
 		 200 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  26.26 
 
 		 200 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  23.32 
 
 		 200 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  22.8 
 
 		 200 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  25.26 
 
 		 202 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  30.85 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  26.77 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  27.45 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  23.81 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  24.48 
 
 		 203 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  27.22 
 
 		 182 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  23.85 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  25.97 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  25.38 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  25.4 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  26.85 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  24.9 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1132  methionine sulfoxide reductase B  24.08 
 
 		 202 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  24.48 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  24.8 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  21.67 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  23.4 
 
 		 202 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  24.17 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  24.48 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  24.57 
 
 		 293 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  24.48 
 
 		 292 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  24.58 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  24.69 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  23.94 
 
 		 301 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1358  type IV pilus assembly family protein  22.56 
 
 		 485 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.590178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  24.11 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  26.46 
 
 		 307 aa  43.9  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>