28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4420 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  64.77 
 
 		 203 aa  257  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  53.27 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  46.94 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  47.72 
 
 		 200 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  47.72 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  47.72 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  47.72 
 
 		 200 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  46.23 
 
 		 200 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  49.74 
 
 		 200 aa  191  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  51.52 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  45.03 
 
 		 202 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  29 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  26.26 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  24.1 
 
 		 482 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  26.32 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  24.1 
 
 		 481 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0382  MshA biogenesis protein MshI-2  29.55 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  22.7 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  20.62 
 
 		 479 aa  54.7  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  23.7 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  25.5 
 
 		 553 aa  48.5  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3093  fimbrial assembly family protein  22.99 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0761  hypothetical protein  23.91 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0217944  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  24.62 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>