30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05881 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  86.34 
 
 
454 aa  839    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  100 
 
 
454 aa  945    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  57.42 
 
 
464 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  55.82 
 
 
463 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  54.12 
 
 
472 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.04 
 
 
672 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  35.45 
 
 
394 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  41.49 
 
 
1844 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.28 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  38.54 
 
 
457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
457 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  33.41 
 
 
404 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 
398 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.34 
 
 
424 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.08 
 
 
1016 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.73 
 
 
396 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.83 
 
 
396 aa  216  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
391 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.47 
 
 
411 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  32.52 
 
 
410 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  37.4 
 
 
705 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.08 
 
 
447 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 
401 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
341 aa  116  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
279 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  25.2 
 
 
374 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  26.06 
 
 
309 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  25.82 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  37.37 
 
 
98 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>