34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03498 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  41.61 
 
 
426 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  37.03 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  36.34 
 
 
367 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  37.17 
 
 
403 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  38.1 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  36.83 
 
 
436 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  36.83 
 
 
436 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  35.14 
 
 
353 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  35.31 
 
 
478 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  35 
 
 
490 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  35.95 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  33.99 
 
 
441 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  32.17 
 
 
449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  31.85 
 
 
329 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  29.25 
 
 
426 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  32.11 
 
 
421 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  29.07 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  29.75 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  28.8 
 
 
426 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  28.8 
 
 
426 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  28.45 
 
 
478 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  27.1 
 
 
468 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  29.91 
 
 
434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  25.53 
 
 
436 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  27.18 
 
 
438 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  27.18 
 
 
438 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  25.31 
 
 
430 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  25.62 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  25.39 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  26.35 
 
 
682 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  25.55 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>