99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00159 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  96.55 
 
 		 87 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  54.08 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  60 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  55.17 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  54.02 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  56.32 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  54.02 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  52.87 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  52.87 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  52.87 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  52.87 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  53.57 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  58.23 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  50.57 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  49.43 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  53.57 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  54.43 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  48.35 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  53.66 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  54.55 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  51.19 
 
 		 86 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  48.35 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  52.56 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  55.13 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  54.22 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  55 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  54.76 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  47.62 
 
 		 86 aa  93.2  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  48.81 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  48.78 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  51.22 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  51.25 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  47.62 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  46.84 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  51.9 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  51.25 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  38.89 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  49.37 
 
 		 87 aa  84.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  45.78 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  46.32 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  41.98 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  58.97 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1299  membrane protein  46.99 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.863066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  43.9 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  39.02 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  44.87 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  40.24 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  39.76 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  45 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  36.56 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  38.75 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  38.16 
 
 		 729 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  37.93 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  36.9 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  39.29 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  31.87 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  31.87 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1080  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  34.52 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  30.12 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  40.79 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  38.75 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  40.79 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  40.79 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  40.79 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  37.66 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  37.66 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  37.18 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  27.27 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  31.96 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2365  hypothetical protein  35.29 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  38.96 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2878  hypothetical protein  35.29 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  41.67 
 
 		 769 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  31.51 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2051  membrane protein-like protein  37.74 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  37.66 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  37.66 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 760 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  30.34 
 
 		 759 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5063  hypothetical protein  29 
 
 		 126 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1937  membrane protein  35.53 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>