49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003778 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  100 
 
 		 660 aa  1365    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  25.22 
 
 		 695 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  25.78 
 
 		 695 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  25.78 
 
 		 695 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  25.6 
 
 		 695 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  25.59 
 
 		 695 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  26.19 
 
 		 697 aa  204  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  25.47 
 
 		 699 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  25.44 
 
 		 699 aa  193  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  24.52 
 
 		 703 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  25.18 
 
 		 704 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  27.36 
 
 		 668 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  26.2 
 
 		 668 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  27.11 
 
 		 695 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  27.11 
 
 		 695 aa  184  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  27.11 
 
 		 695 aa  184  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  26.52 
 
 		 698 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  26.62 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  25.16 
 
 		 693 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  25.68 
 
 		 674 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  25.84 
 
 		 667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  25.82 
 
 		 672 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  25.65 
 
 		 667 aa  164  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  26.05 
 
 		 667 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  25.76 
 
 		 669 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  25.52 
 
 		 703 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  25.42 
 
 		 662 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  26.07 
 
 		 662 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  26.41 
 
 		 669 aa  157  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  24.17 
 
 		 668 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  25.27 
 
 		 716 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  25.92 
 
 		 716 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  24.54 
 
 		 669 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  24.76 
 
 		 716 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  25.14 
 
 		 716 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  23.28 
 
 		 712 aa  150  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  24.16 
 
 		 668 aa  150  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  24.51 
 
 		 706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  23.27 
 
 		 712 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  23.27 
 
 		 712 aa  143  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  22.79 
 
 		 712 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  24.34 
 
 		 672 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  24.42 
 
 		 698 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  24.48 
 
 		 656 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  22.27 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.91 
 
 		 706 aa  77  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  21.01 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  23.64 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  24.24 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>