30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000275 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  100 
 
 		 454 aa  948    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  86.34 
 
 		 454 aa  819    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  58.06 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  56.22 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  54.41 
 
 		 472 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  35.73 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.28 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  39.35 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.35 
 
 		 457 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  41.34 
 
 		 1844 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  33.78 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 		 1016 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.72 
 
 		 672 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.12 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.26 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.16 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.12 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.1 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.4 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  38.21 
 
 		 705 aa  210  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  33.41 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.87 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  26.36 
 
 		 350 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  25.24 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  25.24 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  36.36 
 
 		 98 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>