18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2355 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  951    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3382  hypothetical protein  39.79 
 
 		 484 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1870  hypothetical protein  39.57 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2563  hypothetical protein  30.35 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  27.41 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4761  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.95 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.55 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1959  hypothetical protein  25.77 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 1082 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3756  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  23.98 
 
 		 1075 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.83 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30 
 
 		 1203 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  22.55 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  26.47 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1357  UvrD/REP helicase  21.52 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.981315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 627 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  22.88 
 
 		 663 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>