33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0885 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  100 
 
 		 335 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  53.47 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  52.6 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  49.85 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  31.72 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  32.67 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  33 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  29.26 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  31.82 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  30.72 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  29.43 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  29.1 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  30.13 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  31.23 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  28.62 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  31.01 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  31.36 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  29.72 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  25.52 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  26.6 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  26.43 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  24.77 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.47 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  24.6 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  25.93 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  24.92 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  22.81 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  24.84 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  25.16 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  23.15 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  21.97 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>