More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0558 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  91.71 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  91.71 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  79.62 
 
 		 216 aa  344  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  79.07 
 
 		 216 aa  342  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  78.77 
 
 		 216 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  78.77 
 
 		 216 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  78.77 
 
 		 216 aa  340  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  80.95 
 
 		 219 aa  339  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  78.3 
 
 		 216 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  78.3 
 
 		 216 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  78.3 
 
 		 216 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  78.3 
 
 		 216 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  79.52 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  77.83 
 
 		 214 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  79.53 
 
 		 216 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  78.77 
 
 		 217 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  79.62 
 
 		 214 aa  332  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  78.57 
 
 		 219 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  83.41 
 
 		 217 aa  314  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  70.09 
 
 		 227 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  71.43 
 
 		 221 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  70.48 
 
 		 222 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  70.56 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  71.69 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  69.59 
 
 		 220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  69.59 
 
 		 220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  69.59 
 
 		 220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  63.59 
 
 		 218 aa  296  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  63.51 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  70.97 
 
 		 220 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  70.97 
 
 		 220 aa  284  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  71.76 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  62.79 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  54.15 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  53.81 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  53.96 
 
 		 239 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  56.92 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  47.46 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  42.93 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  46.93 
 
 		 185 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 190 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  44.71 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 187 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  41.44 
 
 		 189 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  43.92 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  43.89 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  43.89 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  41.63 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  44.75 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  41.63 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  44.69 
 
 		 193 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 		 188 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  44.86 
 
 		 205 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  45.3 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 187 aa  141  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  46.41 
 
 		 186 aa  141  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  45.11 
 
 		 194 aa  141  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 		 189 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  48.54 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  44.15 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  41.31 
 
 		 212 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  42.44 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  44.27 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  44.94 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  43.96 
 
 		 194 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  42.93 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  41.05 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  43.33 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  43.59 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  43.82 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>