291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0488 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0488  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl249  nifU protein  31.69 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000700074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.85 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.2 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.29 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.69 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.08 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.5 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.82 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  29.55 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.15 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.06 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  29.73 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  29.41 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.17 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.41 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.28 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.17 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.55 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  28 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.92 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  25.83 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  27.69 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.21 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  26.12 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.01 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  26.87 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  27.01 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.01 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0468  hypothetical protein  31.47 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.0062089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.67 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.15 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.63 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.24 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.26 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.92 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.68 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.57 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.15 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.95 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  28.36 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.93 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.49 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  26.81 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.09 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  30.53 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  31.34 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  29.45 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  30.08 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  27.27 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf185  IscU, NifU-like protein involved in Fe-S cluster formation  31.11 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0138458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  28.57 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.03 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.48 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.48 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.26 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.03 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  32.43 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  28.03 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  25.36 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.03 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  28.03 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  24.64 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  23.48 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.41 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  28.03 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  28.03 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.21 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.88 
 
 
158 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.13 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  22.39 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.15 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  32.31 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.46 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.19 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.26 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.5 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  27.74 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.76 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.29 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.87 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.74 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.74 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  28.36 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  25.62 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.31 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.62 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>