16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0632 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  100 
 
 
809 aa  1661    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  100 
 
 
809 aa  1661    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1740  hypothetical protein  37.85 
 
 
885 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.68 
 
 
790 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  28.9 
 
 
1323 aa  274  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  27.09 
 
 
576 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  28.11 
 
 
755 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  24.92 
 
 
748 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  23.89 
 
 
723 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  26.81 
 
 
1091 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.47 
 
 
611 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  24.5 
 
 
475 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  23.64 
 
 
456 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  26.73 
 
 
501 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  25.73 
 
 
434 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>