16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1681 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 325 aa  646    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  29.14 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 274 aa  85.9  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  27.14 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0464  solute binding protein-like protein  27.78 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2755  glycoside hydrolase family 12  29.79 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00186286  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0340  glycoside hydrolase family 12  24.68 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1988  hypothetical protein  26.99 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  29.49 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0848  hypothetical protein  29.06 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.420421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  28.21 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  27.65 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>