More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1605 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1605  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 382 aa  781    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.119603  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.56 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.11 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.553132 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.07 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0675  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.24 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1593  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.18 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.516871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.48 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.630911 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0185  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.3 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.374978  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1238  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.32 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  35.44 
 
 		 294 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  36.69 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  35.66 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  35.29 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  35.29 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  36.14 
 
 		 294 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  37.46 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  35.29 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  35.17 
 
 		 295 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  36.75 
 
 		 292 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  37.46 
 
 		 292 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  37.46 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 292 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  34.6 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  34.6 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  36.49 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  36.59 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  35.05 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  37.19 
 
 		 297 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  35.44 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  34.88 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  36.27 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  36.14 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  35.19 
 
 		 293 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  33.68 
 
 		 291 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  36.67 
 
 		 320 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  36.24 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  35.99 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  34.39 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  35.99 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  36.75 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  35.99 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  35.99 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  35.29 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  34.71 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  35.99 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  35.99 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  35.44 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  35.64 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  32.89 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  34.83 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  34.26 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  36.71 
 
 		 298 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  36.49 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  35.79 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  35.79 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  36.84 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  34.12 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  33.89 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  35.09 
 
 		 303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  37.84 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  32.16 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  34.22 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  35.09 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  32.76 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  35.67 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  35.44 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  35.6 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  35.05 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.35 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  34.74 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  36.14 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  36.14 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  35.17 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  34.74 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  35.09 
 
 		 312 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  34.74 
 
 		 297 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  34.74 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.65 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  35.09 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  32.45 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  33.91 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  33.77 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  35.44 
 
 		 300 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  32.12 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  37.01 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  31.62 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  34.74 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>