21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1066 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  39.55 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  37.17 
 
 		 136 aa  87.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  40.18 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  40.32 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  35.78 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  31.45 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  37.19 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  38.84 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  33.94 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  43.84 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  35.63 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  31.4 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  43.64 
 
 		 684 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.78 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.78 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  27 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  27 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  31.48 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 306 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>