12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3899 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  286  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  55.97 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  47.73 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  39.84 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  37.17 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  32.14 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  33.61 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  34.45 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4076  hypothetical protein  88.89 
 
 		 42 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  45.65 
 
 		 193 aa  48.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  25.74 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>