18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00870 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  55.97 
 
 		 136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  50.39 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  35.94 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  37.01 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  39.09 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  35.11 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  29.2 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  32.88 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.3 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  25.23 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  31.43 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  31.43 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  36.62 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 286 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>