15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2111 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2111  nuclease  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  37.78 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  40.28 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  35.21 
 
 		 128 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  38.67 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  43.84 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  45.65 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  32.88 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  42.03 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  38.24 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  44.9 
 
 		 417 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  29.93 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.33 
 
 		 488 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.31 
 
 		 94 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.31 
 
 		 94 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>