15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6955 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  40.94 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  40.35 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  43.56 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  39.82 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  40.83 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  39.09 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  43.18 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  39.67 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  40.91 
 
 		 278 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  35.21 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  32.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3031  ParB domain protein nuclease  46.51 
 
 		 411 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>