28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1545 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  50.57 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  50.38 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0559  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  31.01 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  39.67 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  26.67 
 
 		 177 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1018  putative nucleotidyltransferase  30.67 
 
 		 200 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602577  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1038  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2150  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  32.58 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  30.48 
 
 		 130 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3502  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB subunit  27.59 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0202  hypothetical protein  22.63 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.361982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0746  hypothetical protein  30.5 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1581  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  21.69 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0939  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  25.52 
 
 		 197 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  0.929646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  35.23 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  32.81 
 
 		 168 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  28.68 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.17 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  37.7 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.75 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  40.68 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  34.52 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2192  hypothetical protein  44.68 
 
 		 187 aa  42.4  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00717713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  37.72 
 
 		 455 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>