54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0746 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0746  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1446  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  50 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.95951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1407  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  50 
 
 
201 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000635421  normal  0.360925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2150  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  46.73 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78489  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0939  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  40.84 
 
 
197 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  0.929646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1018  putative nucleotidyltransferase  36.9 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3457  putative nucleotidyltransferase  34.38 
 
 
203 aa  117  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2093  putative nucleotidyltransferase  32.09 
 
 
201 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2088  putative nucleotidyltransferase  32.12 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0234  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  33.17 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1581  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  26.53 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0006  5'-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  31.98 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.318315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0142  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.98 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.854914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2497  GTP:adenosylcobinamide- phosphateguanylyltransfer ase  33.33 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0101489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2835  GTP:adenosylcobinamide-phosphateguanylyl transferase-like protein  30.85 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0202  hypothetical protein  28.86 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.361982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0162  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.998873  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0722  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.233715  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  31.97 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0989  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.22 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0067  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.66 
 
 
449 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0038  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.32 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  25.78 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0559  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  32.46 
 
 
166 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0076  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  24.23 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  30.5 
 
 
280 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2629  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.14 
 
 
467 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0658  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.23 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.64009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2079  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.27 
 
 
462 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  50.98 
 
 
383 aa  45.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  43.28 
 
 
247 aa  45.1  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0501  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
460 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0101066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  30.12 
 
 
391 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  48.08 
 
 
854 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.9 
 
 
355 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.91 
 
 
453 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  0.000000146766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0586  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.35 
 
 
469 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000143766  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  29.7 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.98 
 
 
356 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.82 
 
 
358 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.14 
 
 
349 aa  42.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  32.46 
 
 
364 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1244  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein  34.55 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1161  Nucleotidyl transferase  29.36 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0196  hypothetical protein  30.4 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  39.62 
 
 
235 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.03 
 
 
240 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  29.77 
 
 
397 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
244 aa  41.6  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  41.82 
 
 
253 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  29.7 
 
 
348 aa  41.6  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1060  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  26.5 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>