16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8477 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  39.06 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  40.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  34.13 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  32.33 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  32.14 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  40.83 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  32.54 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  29.2 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  36.84 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  29.55 
 
 		 512 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  32.94 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  41.27 
 
 		 222 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  32.35 
 
 		 292 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  34.78 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.29 
 
 		 421 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>