44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3799 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  100 
 
 
62 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  42.59 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  42.59 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  40.98 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  42.59 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  45.16 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  40.74 
 
 
63 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  42.31 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  42.31 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  41.94 
 
 
349 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  42.31 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  42.59 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  37.7 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 
60 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  33.96 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 
61 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  35.19 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  36.54 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  36.36 
 
 
62 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  36.36 
 
 
62 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.33 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.74 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  30.16 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  42.11 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  34.92 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.93 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  29.51 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.43 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>