187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3299 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  73.74 
 
 		 462 aa  646    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  75.11 
 
 		 480 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  100 
 
 		 473 aa  923    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  73.91 
 
 		 461 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  73.32 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  72.89 
 
 		 463 aa  621  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  72.27 
 
 		 461 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  72.27 
 
 		 461 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  72.27 
 
 		 461 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  73.36 
 
 		 459 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  67.91 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  70.5 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  71.43 
 
 		 464 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  66.67 
 
 		 478 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  64.86 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  63.82 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  67.45 
 
 		 476 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  67.47 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  66.16 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  65.94 
 
 		 465 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  63.93 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  62.92 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  60.12 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  60.22 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.72 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.9 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.84 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.28 
 
 		 487 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  40.99 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.7 
 
 		 505 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  40.78 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  40.77 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.27 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  41.24 
 
 		 487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  43.96 
 
 		 473 aa  335  9e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  48.31 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  40.26 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.36 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.03 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  29.15 
 
 		 306 aa  67  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  27.49 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.64 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.04 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.57 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.72 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.91 
 
 		 341 aa  57  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.54 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  25 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  26.58 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.7 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  25 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  29.11 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  27.83 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  28.1 
 
 		 334 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1149  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.8 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00861618  hitchhiker  0.000070257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.81 
 
 		 336 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.69 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.79 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  27.45 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.11 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.49 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  29.79 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.19 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.19 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  31.97 
 
 		 683 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  25 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.51 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.23 
 
 		 329 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  28.57 
 
 		 719 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.29 
 
 		 324 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.38 
 
 		 314 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.24 
 
 		 363 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.55 
 
 		 337 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.55 
 
 		 337 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  30.47 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.89 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  28.64 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.35 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.37 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.5 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.86 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.78 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.47 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  34.95 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  28 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.64 
 
 		 673 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.07 
 
 		 326 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  30.5 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.24 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.11 
 
 		 678 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.64 
 
 		 673 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.92 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.78 
 
 		 326 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.27 
 
 		 306 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  28.99 
 
 		 620 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.85 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  26.87 
 
 		 317 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.27 
 
 		 306 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.69 
 
 		 672 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  34.48 
 
 		 323 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>