22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3258 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  39.77 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  39.77 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  37.72 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  38.86 
 
 		 229 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  38.78 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  33.6 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  34.62 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  33.11 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  34.91 
 
 		 452 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  27.82 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  36.91 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.19 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  33.91 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  23.83 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  23.99 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  28.23 
 
 		 195 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  29.58 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04719  conserved hypothetical protein similar to Rho guanine nucleotide exchange factor (Eurofung)  41.82 
 
 		 1199 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  29.35 
 
 		 470 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  28.68 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>