35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2998 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  40.98 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  39.68 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  40.98 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  40.98 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  38.33 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  37.7 
 
 		 679 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2343  hypothetical protein  41.54 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0539871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  32.79 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 573 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  32.79 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  36.51 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  36.51 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 573 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 573 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  32.84 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1648  hypothetical protein  41.51 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2376  hypothetical protein  43.28 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000039933  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2293  hypothetical protein  41.54 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0567352  unclonable  0.0000000000381377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  40.35 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  35 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  36.07 
 
 		 70 aa  43.5  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  31.34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  31.34 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  31.34 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  29.85 
 
 		 69 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  34.43 
 
 		 709 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  35.59 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  27.87 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>