16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1778 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1778  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
205 aa  389  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.847785 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0347  hypothetical protein  76.21 
 
 
206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1318  hypothetical protein  61.19 
 
 
207 aa  229  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0142607  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1158  hypothetical protein  52.15 
 
 
204 aa  143  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1058  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0332  hypothetical protein  31.19 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  26.76 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.33 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.67 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  25.14 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.49 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.66 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1231  hypothetical protein  29.05 
 
 
204 aa  42  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0770678  normal  0.324963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  28.39 
 
 
211 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>