29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0237 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  85.96 
 
 
231 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  78.95 
 
 
230 aa  345  5e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  74.34 
 
 
234 aa  316  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  47.83 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  43.42 
 
 
122 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  57.45 
 
 
116 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  41.05 
 
 
134 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  60.47 
 
 
115 aa  52  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  55.81 
 
 
107 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  58.14 
 
 
107 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  58.14 
 
 
108 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 
307 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  51.06 
 
 
107 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  52.17 
 
 
102 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  47.62 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  54.76 
 
 
108 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 
109 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 
106 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  51.11 
 
 
110 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  39.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  36.84 
 
 
107 aa  45.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  52.27 
 
 
307 aa  45.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  50 
 
 
126 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  44 
 
 
121 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  47.62 
 
 
109 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>