31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2150 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.03 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  72.03 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.03 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.03 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.43 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.43 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  45.13 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  36.04 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3060  cupin domain protein  36.71 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.49 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  24.07 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0248  cupin 2 domain-containing protein  34.11 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0330  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28 
 
 		 491 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00801876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2209  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.08 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00321721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2423  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.73 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.000878744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 115 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2312  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.73 
 
 		 479 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0322089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  32.26 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2310  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.38 
 
 		 479 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0268586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0301  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28 
 
 		 491 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.503708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0790  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.36 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.916465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0685  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.36 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0525  13S globulin  35 
 
 		 88 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>