35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0950 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  97.06 
 
 
477 aa  904    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  69.73 
 
 
468 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  67.36 
 
 
466 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  82.21 
 
 
489 aa  786    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  69.42 
 
 
472 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  70 
 
 
472 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  960    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  69.23 
 
 
469 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  97.06 
 
 
477 aa  905    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  68.6 
 
 
476 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  68.6 
 
 
476 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  70.12 
 
 
491 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  69.75 
 
 
472 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  69.21 
 
 
472 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  67.78 
 
 
469 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  52.79 
 
 
494 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  52.65 
 
 
498 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  53.03 
 
 
504 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  51.38 
 
 
502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  51.19 
 
 
502 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  49.8 
 
 
501 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  50 
 
 
501 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  49.7 
 
 
495 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  42.07 
 
 
513 aa  339  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  39.84 
 
 
505 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  41.89 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  42.3 
 
 
498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  44.92 
 
 
498 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  38.82 
 
 
473 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  38.37 
 
 
473 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  36.1 
 
 
494 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2757  hypothetical protein  39.84 
 
 
484 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249947  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  28.82 
 
 
437 aa  107  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  25.09 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  25.09 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>