64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0495 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  60.27 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  59.7 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  42.86 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  39.19 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  36.99 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  42.5 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  29.11 
 
 		 666 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  35.21 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  27.63 
 
 		 653 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.65 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.62 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1273  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.68 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308673  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  34.18 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.38 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0843  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.56 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0194425  normal  0.0837964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1172  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.71 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  27.14 
 
 		 667 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  30.3 
 
 		 659 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  32.35 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  31.08 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.57 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.62 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  34.25 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  29.17 
 
 		 645 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.77 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  29.87 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  29.87 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.65 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  29.87 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  29.87 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  29.87 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  26.92 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  29.17 
 
 		 645 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  31.58 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000048911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0531  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.77 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00863384  normal  0.0986491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  27.16 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0176  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30 
 
 		 165 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.94 
 
 		 565 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  28.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  27.27 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1924  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  26.25 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  24.32 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  28.36 
 
 		 573 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  28.95 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1171  ferredoxin-like protein  32.89 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  23.38 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2183  formate dehydrogenase subunit gamma  26.67 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 		 569 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0147  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.11 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3518  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  27.27 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  28.21 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1845  hypothetical protein  32.47 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  28.21 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.64 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2081  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  25.33 
 
 		 150 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.410496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>