19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0446 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  39.76 
 
 		 1065 aa  735    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  39.41 
 
 		 1065 aa  752    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  100 
 
 		 1070 aa  2160    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  42.99 
 
 		 1090 aa  840    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  31.22 
 
 		 874 aa  329  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  24.33 
 
 		 829 aa  73.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 612 aa  73.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.39 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  26.14 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  23.3 
 
 		 454 aa  54.7  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.61 
 
 		 754 aa  54.3  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 512 aa  52.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  36.62 
 
 		 467 aa  52.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.35 
 
 		 737 aa  51.6  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.7 
 
 		 428 aa  51.6  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  31.25 
 
 		 436 aa  50.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  22.19 
 
 		 446 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 428 aa  45.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.3 
 
 		 468 aa  45.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>