29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0434 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  49.81 
 
 		 417 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  45.56 
 
 		 445 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  45.17 
 
 		 439 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  45.17 
 
 		 437 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  51.12 
 
 		 765 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  36.96 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  42.06 
 
 		 458 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  33.98 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  33.21 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  33.21 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  35.77 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  35.11 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  33.33 
 
 		 426 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  31.6 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  29.76 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  33.06 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  32.26 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  29.25 
 
 		 572 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  27.63 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  30.68 
 
 		 433 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  38.36 
 
 		 406 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  30.2 
 
 		 390 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  25.52 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  27.27 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  24.71 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  24.71 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  36.56 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  34.74 
 
 		 729 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>