29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1003 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  100 
 
 		 265 aa  550  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  36.57 
 
 		 426 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  33.15 
 
 		 433 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  30.73 
 
 		 406 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  48.89 
 
 		 417 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  28.93 
 
 		 458 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  30.96 
 
 		 439 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  30.96 
 
 		 437 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  38.1 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  30.46 
 
 		 445 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  32.96 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  25.11 
 
 		 729 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  25.52 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  25.29 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  27.1 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  25.29 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  27.33 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  28.65 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  25.17 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  31.15 
 
 		 390 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  25 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  25 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  29.77 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  26.14 
 
 		 765 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  24.18 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  23.98 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  26.57 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  26.57 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  30.5 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>