29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3784 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  44.03 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  45.08 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  45.08 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  44.35 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  41.74 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  41.49 
 
 		 393 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  41.94 
 
 		 439 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  41.53 
 
 		 445 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  41.13 
 
 		 437 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  38.55 
 
 		 417 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  38.3 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  36.51 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  36.96 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  41.07 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  42.7 
 
 		 765 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  39.39 
 
 		 406 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  32.77 
 
 		 572 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  38.33 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  38.33 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  34.78 
 
 		 433 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  33.6 
 
 		 426 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  30.85 
 
 		 412 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  29.35 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  38.1 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  32.97 
 
 		 406 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  28.65 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  25 
 
 		 729 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  33.67 
 
 		 728 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>