32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4501 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  100 
 
 		 572 aa  1158    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  44.83 
 
 		 254 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  42.06 
 
 		 267 aa  183  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  37.56 
 
 		 271 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  37.16 
 
 		 405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  37.16 
 
 		 405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  35.37 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  32.67 
 
 		 257 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  33.92 
 
 		 251 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  35.87 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  33.49 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  31.88 
 
 		 262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  33.49 
 
 		 445 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  31.4 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  33.18 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  31.02 
 
 		 393 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  31.74 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  29.57 
 
 		 257 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  28.57 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  29.57 
 
 		 257 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  29.88 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  33.68 
 
 		 406 aa  96.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  26.67 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  31.35 
 
 		 765 aa  90.9  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  29.35 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  27.33 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  25.14 
 
 		 412 aa  67  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3955  hypothetical protein  29.45 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.603352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  21.58 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  27.48 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.08 
 
 		 2449 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.43 
 
 		 2179 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>