29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3005 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  100 
 
 		 431 aa  881    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  44.35 
 
 		 257 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  44.26 
 
 		 251 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  38.56 
 
 		 257 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  38.56 
 
 		 257 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  38.36 
 
 		 262 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  30.5 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  39.01 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  29.98 
 
 		 439 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  28.74 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  36.64 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  28.86 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  33.98 
 
 		 271 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  32.49 
 
 		 254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  37.29 
 
 		 765 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  32.77 
 
 		 267 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  29.54 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  25.52 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  32.13 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  32.13 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  29.88 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  28.9 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  29.65 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  30.73 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  29.59 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  29.77 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  24.86 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  22.08 
 
 		 728 aa  43.5  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  21.08 
 
 		 729 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>