31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1878 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  100 
 
 		 458 aa  940    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  46.2 
 
 		 445 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  45.11 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  45.11 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  43.59 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  41.07 
 
 		 257 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  42.06 
 
 		 271 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  38.78 
 
 		 426 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  35.71 
 
 		 267 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  35.98 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  40.22 
 
 		 765 aa  133  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  29.54 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  36.04 
 
 		 572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  32.64 
 
 		 257 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  32.64 
 
 		 257 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  33.72 
 
 		 393 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  32 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  33.04 
 
 		 254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  29.34 
 
 		 262 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  32.35 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  27.56 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  33.73 
 
 		 390 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  33.18 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  33.18 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  34.09 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  28.93 
 
 		 265 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  30.48 
 
 		 729 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  27.09 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  25.91 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1907  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  23.64 
 
 		 1524 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3803  SPP1 family phage head morphogenesis protein  23.64 
 
 		 1529 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>