20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2918 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  204  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  56.44 
 
 
99 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  44.66 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  43.27 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  43.69 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  41.86 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  36.27 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  38.64 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  31.68 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  38.89 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  32.99 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  32.97 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  34.15 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5768  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.420721  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  29.67 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>