More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1500 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 		 388 aa  771    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  67.03 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  63.66 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  62.92 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  60.36 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  60.36 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  60.36 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5136  alkanesulfonate monooxygenase  62.53 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  61.16 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  63.69 
 
 		 378 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  61.56 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3410  Alkanesulfonate monooxygenase  57.97 
 
 		 374 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2833  alkanesulfonate monooxygenase  56.95 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  57.46 
 
 		 379 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1372  Alkanesulfonate monooxygenase  57.54 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  56.34 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1579  Alkanesulfonate monooxygenase  60.05 
 
 		 390 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  59.21 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  58.47 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  58.19 
 
 		 391 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  58.76 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  57.75 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  56.62 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  57.18 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  56.95 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  55.46 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  56.02 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  57.18 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  56.58 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  56.58 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  56.47 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  57.7 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  56.02 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  56.3 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  53.65 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  54.37 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  53.39 
 
 		 385 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  55.87 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  54.59 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  56.02 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  55.46 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  54.62 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  54.52 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  53.22 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5022  alkanesulfonate monooxygenase  58.4 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  55.19 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2051  alkanesulfonate monooxygenase  54.21 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  55.18 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  55.18 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  55.18 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  58.19 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  55.37 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  54.96 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  53.52 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  54.7 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  55.07 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  55.18 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  55.18 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  55.46 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  54.34 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  55.46 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  55.18 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  55.46 
 
 		 382 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  55.1 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  54.82 
 
 		 387 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  55.18 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  54.06 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  55.92 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  54.34 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  56.02 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  56.55 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2773  Alkanesulfonate monooxygenase  54.67 
 
 		 377 aa  359  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  53.82 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  53.12 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  57.26 
 
 		 394 aa  357  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  53.12 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  54.65 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3511  alkanesulfonate monooxygenase  54.34 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  53.12 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  52.86 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  54.08 
 
 		 384 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  52.12 
 
 		 380 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  53.83 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  56.02 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  56.04 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  56.02 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  54.27 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  54.79 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  52.66 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3498  alkanesulfonate monooxygenase  53.78 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  50.71 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3571  alkanesulfonate monooxygenase  53.78 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55225  normal  0.0903973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2750  Alkanesulfonate monooxygenase  56.37 
 
 		 360 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  54.14 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1989  alkanesulfonate monooxygenase  52.86 
 
 		 503 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1821  alkanesulfonate monooxygenase  52.86 
 
 		 385 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0779  alkanesulfonate monooxygenase  52.86 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0825732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1725  alkanesulfonate monooxygenase  52.86 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0382  alkanesulfonate monooxygenase  52.86 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  51.23 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>