27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1315 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  42.56 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  37.89 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  44.4 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  44.16 
 
 
238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  37.22 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  36.4 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  39.58 
 
 
261 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  38.01 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  37.59 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  38.14 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  51.89 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  47.12 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  35.83 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1556  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0182059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4155  hypothetical protein  35.68 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000191684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  30.25 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  30.25 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  30.25 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  36.73 
 
 
470 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  31.78 
 
 
231 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  32.73 
 
 
232 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  35.24 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  29 
 
 
467 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  38.14 
 
 
436 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>