161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0443 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  100 
 
 
475 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  70.26 
 
 
471 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  68.61 
 
 
463 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  70.41 
 
 
469 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  69.33 
 
 
465 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  68.05 
 
 
477 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  67.67 
 
 
503 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  63.82 
 
 
473 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  62.91 
 
 
480 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  67.32 
 
 
507 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  64.64 
 
 
476 aa  547  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  64.76 
 
 
461 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  63.46 
 
 
463 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  63.46 
 
 
463 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  61.67 
 
 
462 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  61.89 
 
 
461 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  61.89 
 
 
461 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  61.89 
 
 
461 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  63.2 
 
 
511 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  59.78 
 
 
469 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  62.06 
 
 
475 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  58.62 
 
 
478 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  62.72 
 
 
464 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  61.65 
 
 
459 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50.32 
 
 
464 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.27 
 
 
475 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.24 
 
 
502 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.57 
 
 
505 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.62 
 
 
499 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.86 
 
 
487 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.19 
 
 
486 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.35 
 
 
512 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  42.44 
 
 
487 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  41.74 
 
 
497 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.41 
 
 
460 aa  365  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.12 
 
 
510 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  41.42 
 
 
510 aa  362  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  45.2 
 
 
473 aa  356  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  44.8 
 
 
473 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.41 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25.33 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  31.38 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.98 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.57 
 
 
373 aa  60.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.55 
 
 
369 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  26.07 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.97 
 
 
358 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.97 
 
 
358 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.34 
 
 
364 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  25.55 
 
 
304 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.08 
 
 
405 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.64 
 
 
337 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  28.22 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.64 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.24 
 
 
336 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  25.39 
 
 
307 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  23.05 
 
 
631 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.13 
 
 
337 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.03 
 
 
340 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.69 
 
 
340 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  21.44 
 
 
642 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.76 
 
 
368 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.51 
 
 
325 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  28 
 
 
719 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  24.48 
 
 
304 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  29.46 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  38.46 
 
 
328 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  29.61 
 
 
334 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  29.61 
 
 
334 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.93 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  29.61 
 
 
334 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.03 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  32.81 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  31.2 
 
 
309 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  29.33 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1750  ATPase  24.73 
 
 
353 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.71 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  33.33 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.95 
 
 
403 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.55 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  22.71 
 
 
631 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  25.47 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  25.47 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  26.83 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.55 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.45 
 
 
326 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.09 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 
332 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.95 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.62 
 
 
341 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  21.1 
 
 
631 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.95 
 
 
362 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.63 
 
 
329 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  32.61 
 
 
372 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.95 
 
 
362 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.95 
 
 
362 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.82 
 
 
302 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 
324 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.51 
 
 
351 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>