172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0009 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  100 
 
 
119 bp  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 
119 bp  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 
119 bp  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 
119 bp  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  95.56 
 
 
116 bp  73.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 
116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 
115 bp  69.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  93.62 
 
 
117 bp  69.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  97.44 
 
 
116 bp  69.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 
116 bp  61.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  60  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  60  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  60  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 
117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 
117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 
117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 
114 bp  58  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 
114 bp  58  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 
117 bp  58  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 
116 bp  54  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
118 bp  54  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
122 bp  54  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 
116 bp  54  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0003  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0014  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0027  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0065  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0070  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0088  5S ribosomal RNA  96.77 
 
 
117 bp  54  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.875375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 
117 bp  54  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  90.7 
 
 
116 bp  54  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
116 bp  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0189262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 
115 bp  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 
117 bp  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
116 bp  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
116 bp  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0011  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
116 bp  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
116 bp  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
116 bp  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  100 
 
 
115 bp  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  100 
 
 
115 bp  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0007  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
115 bp  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146572  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0055  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
115 bp  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0551184  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3003  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3006  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3009  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3012  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3015  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3019  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r06  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r12  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r15  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r18  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r21  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r24  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  100 
 
 
127 bp  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 
118 bp  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0040  5S ribosomal RNA  100 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0050  23S ribosomal RNA  100 
 
 
115 bp  48.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0037  5S ribosomal RNA  100 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0046  5S ribosomal RNA  100 
 
 
114 bp  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>