20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4274 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  53.75 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  47.5 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  32.47 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  31.17 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  35.8 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  28.75 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  32.1 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  31.25 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  27.5 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  28.92 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  31.25 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4031  hypothetical protein  29.49 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2063  protein of unknown function UPF0175  28.21 
 
 		 82 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1722  hypothetical protein  29.49 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  27.5 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>