239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4177 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4177  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  74.48 
 
 
248 aa  367  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.22 
 
 
240 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  75.83 
 
 
240 aa  362  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  74.04 
 
 
235 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  74.04 
 
 
235 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1500  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  75.11 
 
 
241 aa  347  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1194  pyridoxine 5'-phosphate synthase  74.58 
 
 
265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.56 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14741  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 
245 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  0.931321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.14 
 
 
249 aa  300  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0642  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 
245 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.52 
 
 
245 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.1 
 
 
242 aa  297  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.54 
 
 
242 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.54 
 
 
242 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.54 
 
 
242 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.09 
 
 
238 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.23 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.43 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.43 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.43 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.43 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  59.57 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.62 
 
 
239 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
243 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  60.43 
 
 
243 aa  277  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.05 
 
 
238 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.04 
 
 
243 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11981  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.96 
 
 
238 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.526754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.57 
 
 
243 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.74 
 
 
243 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.64 
 
 
239 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.74 
 
 
243 aa  275  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.74 
 
 
243 aa  275  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.78 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.51 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.76 
 
 
239 aa  271  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.78 
 
 
239 aa  271  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.7 
 
 
243 aa  271  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.39 
 
 
246 aa  271  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.7 
 
 
243 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.83 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.26 
 
 
245 aa  268  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.83 
 
 
243 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.52 
 
 
243 aa  267  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.37 
 
 
265 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.3 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
248 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.39 
 
 
250 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.09 
 
 
248 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.83 
 
 
243 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.21 
 
 
239 aa  262  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.21 
 
 
239 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.94 
 
 
247 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.02 
 
 
243 aa  259  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
255 aa  258  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.51 
 
 
246 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.51 
 
 
240 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.51 
 
 
246 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  57.08 
 
 
246 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.54 
 
 
270 aa  257  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.51 
 
 
246 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.85 
 
 
244 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.08 
 
 
246 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.04 
 
 
240 aa  254  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.04 
 
 
251 aa  254  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.52 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.65 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.22 
 
 
246 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.65 
 
 
240 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.65 
 
 
240 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.36 
 
 
241 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.88 
 
 
264 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.7 
 
 
245 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.36 
 
 
241 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.03 
 
 
239 aa  248  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2032  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
251 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.240988  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.88 
 
 
264 aa  247  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.22 
 
 
250 aa  247  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0184  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.63 
 
 
248 aa  245  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.27 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.43 
 
 
265 aa  244  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.04 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.39 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1256  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.74 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.7 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
248 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.83 
 
 
250 aa  241  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.61 
 
 
248 aa  241  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.59 
 
 
245 aa  241  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>