20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3935 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  726    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4924  hypothetical protein  43.15 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.157261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  30.17 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1041  hypothetical protein  34.82 
 
 		 126 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.542193  normal  0.878217 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  26.32 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  25.56 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  32.18 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  32.14 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  26.35 
 
 		 213 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2309  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0600  hypothetical protein  23.18 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2630  putative peptidase A2A  29.29 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.550305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  28.87 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  27.97 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  27.63 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.46 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  30.21 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  27.91 
 
 		 185 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5884  hypothetical protein  24.44 
 
 		 280 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139697  normal  0.0155606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.53 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>