More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3667 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  100 
 
 
356 aa  732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  41.16 
 
 
343 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  38.18 
 
 
343 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 
353 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.87 
 
 
323 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.45 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
443 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
330 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
327 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.26 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
353 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 
340 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 
354 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  25.94 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.54 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.57 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  32.82 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.51 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.54 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  32 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.77 
 
 
289 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  33.84 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31.66 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.96 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  34.18 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.27 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  33.68 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  31.61 
 
 
327 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
286 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.9 
 
 
253 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
286 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  30.05 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.69 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.55 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
255 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.68 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  31.41 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  32.8 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.93 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  30.21 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  32.45 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  32.82 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.58 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.58 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  30.29 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  30.26 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.47 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  33.16 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  31.22 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>