28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4774 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4774  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 98 aa  190  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0340  anti-sigma-factor antagonist  49.52 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0351  anti-sigma-factor antagonist  49.52 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0302265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0361  anti-sigma-factor antagonist  49.52 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1932  anti-sigma-factor antagonist  49.5 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3953  anti-sigma-factor antagonist  46.53 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4422  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3796  anti-sigma-factor antagonist  44.12 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4520  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  51.92 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0393  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00214787  normal  0.11292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  39.62 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50.94 
 
 		 115 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.18 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  39.66 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 		 122 aa  40  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.92 
 
 		 121 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  37.84 
 
 		 122 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 110 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>