17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4478 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  100 
 
 		 242 aa  486  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  30.9 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  27.81 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  30.84 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  26.5 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.16 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3017  RDD domain containing protein  31.56 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  26.15 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  33.94 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  30.51 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  32.39 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  29.38 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  25.37 
 
 		 424 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  23.03 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  23.7 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  27.11 
 
 		 214 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>