46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4339 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  610  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  31.08 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  30.06 
 
 
202 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  31.88 
 
 
166 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  31.03 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.68 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  36.09 
 
 
171 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  28.47 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  28.47 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  28.47 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  28.47 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  28.47 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  26.44 
 
 
225 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  30.77 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  30.77 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  29.67 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  32.26 
 
 
223 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  29.63 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  30.2 
 
 
209 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  26.49 
 
 
244 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 
209 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 
209 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 
209 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  28.35 
 
 
175 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  27.33 
 
 
220 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  28.89 
 
 
164 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  28.89 
 
 
164 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  27.56 
 
 
300 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  25.83 
 
 
164 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  28.83 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  28.67 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  26.49 
 
 
164 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  25.41 
 
 
179 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  25.25 
 
 
213 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  27.65 
 
 
200 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10179  MCE associated membrane protein  31.15 
 
 
244 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  26.32 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  24.22 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  25.71 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  29.41 
 
 
164 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>